基本的には、上書きし、install/update.php　を実行します。
アップグレードの方法は、docs/documentation.en.html に書いてあります。
また、変更されたファイルについては、　docs/CHANGEDFILES　に書かれてあります。
何が変わっているのかを確認する場合は当方は差分と取るソフトとして　DF　を使用してます
また、実際には、新規インストールし、データベースのデータの引越しする方法がスムーズな場合もあります。

• except　とは、「以下の～～を除く」　の意味です。良く使われてます。

最新バージョン（2010/02/06現在）　2.6.2　へのアップ方法として、以下が記されてます。

• a.Upgrading from phpMyFAQ 2.0.x
• b.Upgrading from phpMyFAQ 2.5.x
• c.Upgrading phpMyFAQ 2.6.x versions
• d.Modifying templates for phpMyFAQ 2.6.x

phpMyFAQ 1.4.～1.6　の方は、一度、2.0.X（例えば　2.0.17）にアップする必要があります。

• a.Upgrading from phpMyFAQ 1.4.x
• b.Upgrading from phpMyFAQ 1.5.x
• c.Upgrading from phpMyFAQ 1.6.x
• d.Upgrading phpMyFAQ 2.0.x versions
• e.Modifying templates for phpMyFAQ 2.0.x